中国政府审计机关成立以来，始终坚持以财政财务收支的真实、合法、效益为重点，紧紧围绕改革开放和政府工作中心，全面开展预算执行审计和其他各项审计，每年审计的单位数由1983年的1200多个增加到2005年的12.5万多个。审计工作在促进增收节支、加强宏观管理、推进依法行政、维护群众利益、推动廉政建设等方面发挥了积极作用。
1、财政审计。《审计法》颁布以前，各级审计机关积极开展了对下级政府预算执行情况和决算的审计，在维护财经纪律，促进增收节支等方面发挥了重要的作用。1995年《审计法》实施后，财政审计发生重大变革，开始转向本级预算执行审计与下级政府预算执行和决算审计相结合，以本级预算执行审计为主体，并实行了“两个报告”制度，即审计机关要向本级政府提出对本级预算执行情况的审计结果报告、国务院和县级以上地方人民政府每年要向本级人大常委会提出审计机关对预算执行和其他财政收支的审计工作报告。
自1996年开展本级预算执行审计以来，各级审计机关围绕促进财政管理体制改革，建立社会主义公共财政制度等目标，突出对收入征收机关、政府部门、国债资金、专项资金和预算外资金的审计。通过审计，查处了财政管理中存在的大量违法违规问题，分析揭示了经济领域一些深层次的矛盾和问题，向国家有关部门提出了细化预算、推行部门预算制度和建立国库集中支付制度等许多具有建设性的意见和建议，收到了很好的效果。
2003年以来，随着审计工作形势的发展，财政审计工作有了很大的转变。实现了以中央预算执行审计为重点，由财政收支审计并重向以财政支出审计为主转变；在支出审计方面，由主要审计中央本级支出向中央本级支出与中央补助地方支出审计并重转变，对于深化财政管理体制改革，规范财政税收管理，促进被审计单位和个人依法行政、依法理财都发挥了积极的作用。
2、金融审计。在审计机关成立后相当长一段时间内，中国的金融审计主要审查国有金融机构的财务收支。1995年《审计法》实施后，金融审计逐步转向对国有、国有资本占控股地位或者主导地位金融机构资产、负债和损益的审计监督。2000年以后，金融审计紧紧围绕“风险、管理、效益”问题开展审计，以检查资产质量、查处大案要案、防范风险为重点，既注意审计资产、负债和损益的真实性，又注意发现资产质量和内部控制方面存在的突出问题，揭露一些重大涉嫌经济犯罪的案件线索。在审计中注意从宏观上提出完善政策法规、提高效益、深化改革的建议，为促进加强金融管理、推进金融体制改革、规范金融秩序、防范和化解金融风险发挥了积极作用。
3、国有企业审计。中国的政府审计最早从企业审计开始，当时围绕企业财务收支的合规合法性，重点查处企业漏缴国家税收等违法违规问题。2000年以来，结合企业财务收支审计，逐步走出了一条具有中国特色的以企业领导人任期经济责任审计为中心的企业审计路子，按照“摸家底、揭隐患、促发展”这一思路，重点审计评价企业会计信息特别是盈亏的真实性、重大经济决策合规合法性、资产的质量及保值增值情况、主辅分离及企业改制过程中有无人为造成国有资产流失以及企业领导人员遵纪守法和履行其经济责任的情况。2003至2005年，各级审计机关共审计企业30345户，促进上缴财政收入60亿元，移送重大经济案件线索1303件，成效显著。
从2006年起，各级审计机关在继续做好企业领导人任期经济责任审计的基础上，还积极开展了对企业效益审计工作的探索。
4、农业与资源环保审计。农业与资源环保审计以促进国家农业与资源环境保护投入政策落实为目标，组织开展了农林水利、资源和环境保护资金的审计和审计调查，重点检查国家有关农业与资源环保政策、法规的执行情况，揭露资金投入、分配、管理、使用中的违法违规和效益不高问题。2000年以来，先后组织开展了对国有土地、扶贫、退耕还林、新型农村合作医疗等多项专项资金的审计与审计调查。通过审计，促进规范了专项资金的管理，为国家制定或完善各项方针政策提供了宏观决策依据。农业与资源环保审计已经成为政府加强农业与资源环保工作的有力手段。
